Načelo procesa MBBR je povečanje biomase in vrst v reaktorju z dodajanjem določene količine nosilca suspenzije v reaktor, da se izboljša učinkovitost obdelave reaktorja. Ker je gostota polnila blizu gostote vode, se med prezračevanjem popolnoma pomeša z vodo, okolje za rast mikrobov pa je plin, tekočina in trdna snov. Učinek trčenja in striženja nosilca v vodi naredi zračne mehurčke finejše in poveča stopnjo izkoriščenosti kisika. Poleg tega ima vsak nosilec različne biološke vrste znotraj in zunaj, nekatere anaerobne bakterije ali fakultativne bakterije rastejo znotraj, zunaj pa so dobre trofične bakterije, tako da je vsak nosilec miniaturni reaktor, tako da reakcija nitrifikacije in reakcija denitrifikacije obstajata istočasno. časa, da se izboljša učinek zdravljenja.
